Het nieuwe station Houten vormt het kloppend hart van het vernieuwde stadcentrum. Het bestaande station is compleet vernieuwd en 1,80 meter opgehoogd en daarbij is ook het stationsgebied opnieuw ingericht. Door de ophoging is een ruime onderdoorgang ontstaan met ruimte voor een fietstransferium. In het fietstransferium is onder meer voorzien in 3100 stallingsplaatsen voor fietsen, een fietswinkel met VVV agentschap en oplaadpunten voor elektrische fietsen. In de toekomst kan de capaciteit worden uitgebreid tot 4200 plaatsen. De stalling is gratis en - min of meer - bewaakt (in ieder geval is er regelmatig toezicht). Bijzonder is de manier waarop de stalling – kosten circa €10 miljoen - tot stand kwam, namelijk via een openbare aanbesteding waarbij NS Fiets en U-stal samen tot een aanbieding kwamen. Vanuit de fietsenstallingen kan de reiziger binnendoor via de trap het perron op. Dat is voorzien van 175 meter lange futuristische overkapping en biedt maximaal comfort aan de reiziger. Vanaf het lichte en overzichtelijke eilandperron kijkt men uit over de stad.

In de Vinexwijk Houten Castellum ligt het station ook op de kruising van de sporen en de belangrijkste oost-westverbinding voor langzaam verkeer. Station Houten Castellum ontsluit de gelijknamige nieuwbouwwijk. Bij Houten Castellum wordt een fietstransferium gebouwd voor 1700 fietsen